质粒纯化新策略:从结构解析到层析技术的全流程优化

时间:2025-06-05 14:23:50 点击数:

在基因治疗、mRNA疫苗与细胞治疗的黄金时代,质粒DNA作为核心载体,其纯化技术正迎来前所未有的挑战与机遇如何高效获取高纯度超螺旋质粒?本文将从质粒特性、杂质控制到层析技术创新,为您揭秘关键工艺

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质粒:基因时代的“运输车”

质粒(pDNA)是存在于微生物中的环状双链 DNA 分子,以超螺旋(scDNA)、开环(ocDNA)和线性(L-DNA)三种构型存在。其中,超螺旋结构因活性最高、转染效率最优,成为基因治疗与疫苗载体的 “理想形态”,生产中要求其占比≥80%。作为基因工程的核心工具,它不仅能携带外源基因实现扩增表达,更可搭载 CRISPR-Cas9 进行基因编辑,或直接作为 mRNA 疫苗载体诱导免疫反应,在医药、农业等领域应用广泛。

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Figure 1. 质粒DNA的三种分⼦构型


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纯化难点:异构体和杂质的"双重考验"

质粒常用大肠杆菌制备,生产过程中异构体和杂质的控制是确保产品质量的关键。

分离scDNA是大规模纯化用于DNA疫苗和基因治疗的pDNA载体的关键,⽣产中要求占比≥80%。

主要杂质类型有宿主细胞蛋白(HCP)、宿主细胞RNA(HC-RNA)、宿主基因组DNA(HC-DNA)等、质粒聚集体、内毒素及化学试剂残留等。

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层析技术:精准分离的"核心武器"

多种层析方法可用于纯化pDNA:

 凝胶过滤基于分子量分离,但通量低。

 亲和层析:对scDNA具有较⾼的选择性。
 疏水层析:通过盐浓度梯度分离scDNA与ocDNA。scDNA因碱基暴露程度更高,疏水性显著强于其他异构体,在高盐(如3M硫酸铵)条件下,scDNA与疏水填料的疏水相互作用增强,结合更紧密。而ocDNA因单链断裂导致结构松散,疏水性降低;线性质粒则因双链完全解旋,疏水性进⼀步减弱。这些异构体在高盐条件下无法有效结合填料,通过梯度洗脱(如降低盐浓度至1M)即可被去除

 阴离子交换层析:去除痕量杂质,如内毒素和HCP。

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Figure 2. 质粒DNA三步纯化方案


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Figure 3. 质粒DNA两步纯化方案一

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Figure 4. 质粒DNA两步纯化方案二


两步纯化法可实现更高的上样量、回收率和更快的流速,缩短工艺时间,减少试剂耗材用量和成本,提高质粒纯化效率。

Crysto Shell系列复合模式层析填料同时具有分子筛和阴离子交换层析功能,且采用流穿模式进行纯化,因此具有较高的处理通量。

MoSphere 50V系列超大孔填料,采用亲水性聚甲基丙烯酸酯(PMMA)为基质,其4000Å超大孔径的设计,可以使更多的大尺寸生物分子进入填料孔道内部进行结合,轻松实现高载量、高流速、高效率的纯化。

质粒的生产制备需通过多步骤层析及严格质控,创新分离技术,平衡产量、纯度与成本,以满足基因治疗和疫苗开发的高标准要求,是质粒纯化工艺开发一直追求的目标。

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科诺赛的超大孔色谱分离技术,显著优化了基因治疗药物和mRNA疫苗的下游纯化工艺流程,不仅降低了生产成本、提高了生产效率,而且为整个生物制药行业的快速发展奠定了坚实的技术基础。



MoSphere 50V DEAE 产品一览

MoSphere® 50V DEAE 超大孔弱阴离子交换层析介质,专为超大尺寸复杂生物大分子的分离纯化需求而设计,产品借助特有的表面修饰技术, 将离子交换官能团键合在亲水性基质表面,制备出弱阴离子交换(DEAE)层析介质。

应用领域:质粒、大核酸、VLP 颗粒、狂犬病毒、慢病毒的分离纯化。

产品特点

高结合载载量是常规琼脂糖层析介质的 10 倍以上,是常规聚合物层析介质的 2 倍;

高回收率可保持大分子蛋白或病毒结构的完整性,得到高收率、高活性的目的蛋白;

高分辨率、高柱效分子传质速度快,蛋白或病毒颗粒可轻松进入孔内结合;

非特异性吸附低微球表面进行亲水化改性,可解决某些疏水性强的蛋白或者病毒导致的强吸附问题。


订货信息

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参考⽂献

1.H. Bo et al. Using a single hydrophobic-interaction chromatography to purify pharmaceutical-grade s u p e r c o i l e d p l a s m i d D N A f r o m o t h e r isoforms. J.Pharmaceutical Biology, 2013; 51(1): 42–48

2.M.L. Yu, M.R. Yu, F. Qian, Purification of plasmid DNA using a novel two stage chromatography process.Journal of Chromatography B 1250 (2025). https://doi.org/10.1016/j.jchromb.2024.124381


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